Η Ελένη Τζαβάρα ασχολείται με τη δημιουργία νέων φαρμάκων για την αντιμετώπιση ψυχιατρικών παθήσεων όπως η κατάθλιψη, η μανιοκατάθλιψη και η σχιζοφρένεια. Το 2008 τιμήθηκε με τα Επιστημονικά Βραβεία του Ιδρύματος Μποδοσάκη. Η ερευνητική της δραστηριότητα μελετά τις διαταραχές της νευροδιαβίβασης και της συναπτικής πλαστικότητας που συνδέονται με την παθογένεση ψυχικών παθήσεων, με έμφαση στη σχιζοφρένεια και στη μανιοκατάθλιψη. Σκοπός είναι η ταυτοποίηση και η παράδοση νέων μοριακών στόχων, για την ανάπτυξη καινούριων φαρμάκων για τις παθήσεις αυτές.

Η ίδια υποστηρίζει πως η σωστή αντιμετώπιση του ψυχικά ασθενούς βασίζεται στη συνέργεια της φαρμακευτικής αγωγής και της ψυχοθεραπείας. Το πιο σημαντικό είναι η υπεύθυνη τακτική ιατρική παρακολούθηση από τον ψυχίατρο που και θα συνταγογραφήσει το κατάλληλο φάρμακο και θα εφαρμόσει την ενδεικνυόμενη ψυχοθεραπεία. Οι περισσότερες περιπτώσεις νέου επεισοδίου σε έναν ψυχικά ασθενή έχουν σχέση με λανθασμένη διακοπή του φαρμάκου με πρωτοβουλία του ασθενή ή με διακοπή της παρακολούθησης.